L'histoire c'est tout bête :
Un jeune collégien, Junpei, aime aller sur le toit de l'école. Un soir, une belle jeune fille tombe sur lui, et tout ce dont il se rapelle d'elle, c'est de sa culotte à fraises (d'où le titre "ichigo" qui signifie fraise). La jeune fille (la première photo)a laissée derrière elle son cahier. Cependant Junpei sait à qui il appartient : une fille sudieuse et pas du tout attirante... Enfin c'est ce qu'il croit au début.
Ses amis le pousse vers une autre fille (la blonde), la plus populaire du collège et très jolie, qui porte elle aussi des culottes à fraises. L'histoire s'ensuit donc de quiproquos : qui est la mystérieuse fille à culotte à fraise ?